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2017/03/09
81-現在

81年—89年
        民國81年11月1日奉國防部核定將「臺灣軍管區司令部更名為「軍管區司令部」,本部全銜改為「軍管區司令部兼海岸巡防司令部」其主要任務為負責後備軍人管理、動員、服務及臺澎地區海岸巡防,戰時兼負警備作戰為因應解除戒嚴及政治環境邁入民主憲政趨勢。

海岸巡防(機巡)

89年—91年
        民國89年1月,立法院三讀通過「海巡法」,於同年(89年)2月1日軍管、海巡分置,海巡單位移編新成立之「行政院海巡署」,本部恢復銜稱為「軍管區司令部」,主要掌理動員、管理、服務三大工作及戰時警備治安。

軍管區修訂後備司令部授印旗
後備司令部授印及後備司令部大門

91年—迄今
        民國91年3月1日;本部銜稱修訂為「後備司令部」,民國95年1月1日,原聯合後勤司令部「留守業務署」編組體系及業務移編本部,修訂銜稱為「留守業務處」,負責現役軍人保險、撫卹、照護等工作。因應組織調整,民國102年1月1日,本部銜稱修訂為「後備指揮部」,主要任務為策劃執行動員、管理、服務、民防工作、建立後備潛力。