民國88年9月21日凌晨一點四十七分，臺灣遭受地震規模芮氏七.三級地震，罹勤人數超過二千三百多人，傷者近萬人；房屋全倒四萬六千餘戶、半倒五千七百餘戶，災民保守估計近二十萬人，所見之處皆滿目瘡痍。
本部即全體投入調租車、機及經費協調支援災後重建工作以動員車、機速支援災後重建工作為要務，並運用龐大後備組織，動員人、物、財力，完成災後重建任務。 全程計支援5208人次、軍犬85犬次、救援受災民眾4152人次、提供災民各類救援物資計70項、設置10處醫療站，提供災民醫療，計有2029人次、調用車輛、工程重機械計2889車次，供災後重建工作。
