1-警總時期

第一任司令   黃中敏上校

任期:41年10月17日至45年11月1日

第二任司令   陳嘉玉上校

任期:45年12月1日至49年1月16日

第三任司令   鄧桂彬上校

任期:49年1月16日至51年3月16日

第四任司令   梁朝球上校

任期:51年3月16日至53年10月16日

2-軍管區時期

第五任司令   何孝運上校

任期:53年10月16日至57年9月16日

第六任司令   牟降暑上校

任期:57年9月16日至59年10月16日

第七任司令   王催鋒上校

任期:59年10月16日至62年10月16日

第八任司令   鄧雪瑞上校

任期:62年10月16日至65年9月1日

第九任司令   周   璽上校

任期:65年9月1日至68年4月1日

第十任司令   康景文上校

任期:68年4月1日至69年6月16日

第十一任司令   呂興武上校

任期:69年6月16日至71年9月1日

第十二任司令   鄒德鼎上校

任期:71年9月1日至75年3月1日

第十三任司令   范祚胤上校

任期:75年4月1日至77年6月30日

第十四任司令   蔡   鋒上校

任期:77年7月1日至79年11月30日

第十五任司令   劉鳳麟上校

任期:79年12月1日至80年12月1日

第十六任司令   李銘藤上校

任期:80年12月1日至81年5月1日

3-軍管暨海巡時期

第十七任司令   張立達上校

任期:81年5月1日至84年3月31日

第十八任司令   吳文卿上校

任期:84年4月1日至85年11月12日

第十九任司令   廣陸星上校

任期:86年1月1日至88年4月1日

第二十任司令   王苗生上校

任期:88年4月1日至90年3月31日

第二十一任司令   張竹為上校

任期:90年4月1日至92年9月1日

3-後備時期

第二十二任司令   李家順上校

任期:92年9月1日至94年8月31日

第二十三任指揮官   吳繼桐上校

任期:94年9月1日至95年10月31日

第二十四任指揮官   林振和上校

任期:95年11月1日至97年11月15日

第二十五任指揮官   張盛觀上校

任期:97年11月16日至98年3月1日

第二十六任指揮官   石文龍上校

任期:98年3月2日至100年10月1日

第二十七任指揮官   游中逢上校

任期:100年10月1日至101年10月1日

第二十八任指揮官  楊有恆上校

任期:101年10月1日至103年10月1日

第二十九任指揮官  陶成濬上校

任期:103年10月1日至105年12月1日

第三十任指揮官  張明吉上校

任期:105年12月1日至107年8月1日

第三十一任指揮官  李銘議上校

任期:107年8月1日至110年4月1日

第三十二任指揮官  吳俊霖上校

任期:110年4月1日至111年12月1日

 第三十三任指揮官  蔡豐全上校

 任期:111年12月1日至113年3月16日

代理指揮官  吳俊霖上校

任期:113年3月16日至113年5月1日

 第三十四任指揮官  蘇國棟上校

 任期:113年5月1日迄今