人事軍務處
負責國會連絡、內部管理、人力規劃、人事管理、文書檔案等人事管理、勤務與總務事宜。
戰備訓練處
負責戰備整備情報、戰情指管、作戰工事、建軍構想、作戰需求研究、編裝、部隊訓練業務之政策指導、計畫、協調與督導。
後勤處
負責工程營產、軍品整備、醫療衞生及大宗採購作業，建立與增進後備部隊生存及戰鬥持續力。
動員管理處
負責後備軍人管理、編組、選用、召集、訓練及現役軍人退伍、後備軍人除役作業，並完成人、物力及全民防衛動員整備作業。
留守業務處
負責軍人撫卹、葬厝、保險及照護作業，服務國軍官兵與達成軍(遺)眷之安後任務，並置點於官兵亡撫卹、慰助、保險權益維護與協助亡故官兵遺骸安葬(厝)等工作。
主計室
負責本部主計業務，辦理「年度施政計畫與預算編製」、「預算執行」、「會計管理」、「內部審核」、「統計分析」等業務。
政治作戰室
負責官兵心理輔導、文化宣教、軍紀及保密安全、軍眷服務之遂行，以堅定官兵思想，建立共識共行，確保部隊純潔，鞏固部隊安全。
督察室
負責準則發展及研考業務，並辦理軍法教育、法律服務與國家賠償、訴願等事務，確保重大命令貫徹與執行法律事務協助等事務。