為崇祀先烈，表揚國民革命精神，奉先總統蔣公於民國56年核示通過忠烈祠改建委員會組織規程，並於56年12月開工整建，58年3月25日落成啟用，定位為中央政府所在地之「專祠」。每年3月29日及9月3日辦理春、秋國殤大典，由總統親臨主祭；另配合清明節前舉行遙祭黃帝陵典禮、總統就職後舉行遙祭國父陵等國家祭典。原隸國防部史政編譯局，87年7月1日移編聯勤留守業務署，95年1月1日移編後備司令部，因應組織調整於102年1月1日全銜修正為國防部後備指揮部，111年1月1日改隸國防部全民防衛動員署，全銜修訂為國防部全民防衛動員署後備指揮部。